Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Susan Bell",
2
  "author": "Susan Bell",
            
3
  "author_email": "sbell@usf.edu",
3
  "author_email": "sbell@usf.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/N7X0654X"
8
      "value": "doi:10.7266/N7X0654X"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
11
      "key": "ISO.principalInvestigator",
            
12
      "value": "Susan Bell <sbell@usf.edu>"
12
      "value": "Susan Bell <sbell@usf.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Place Keywords",
15
      "key": "Place Keywords",
            
16
      "value": "Tampa Bay, Lassing Park, Fort De Soto, War Memorial 
16
      "value": "Tampa Bay, Lassing Park, Fort De Soto, War Memorial 
            
17
Park"
17
Park"
            
18
    },
18
    },
            
19
    {
19
    {
            
20
      "key": "Temporal Begin",
20
      "key": "Temporal Begin",
            
21
      "value": "2015-07-27"
21
      "value": "2015-07-27"
            
22
    },
22
    },
            
23
    {
23
    {
            
24
      "key": "Temporal End",
24
      "key": "Temporal End",
            
25
      "value": "2016-06-29"
25
      "value": "2016-06-29"
            
26
    },
26
    },
            
27
    {
27
    {
            
28
      "key": "Theme Keywords",
28
      "key": "Theme Keywords",
            
29
      "value": "dissolved oxygen, DO, temperature, oxygen consumption, 
29
      "value": "dissolved oxygen, DO, temperature, oxygen consumption, 
            
30
sediment, respiration, photosynthesis, seagrass, infauna, metabolism"
30
sediment, respiration, photosynthesis, seagrass, infauna, metabolism"
            
31
    },
31
    },
            
32
    {
32
    {
            
33
      "key": "spatial",
33
      "key": "spatial",
            
34
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
34
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
            
35
-82.7708, 27.75382 ], [ -82.62871, 27.75382 ], [ -82.62871, 27.47597 
35
-82.7708, 27.75382 ], [ -82.62871, 27.75382 ], [ -82.62871, 27.47597 
            
36
], [ -82.7708, 27.47597 ], [ -82.7708, 27.75382 ] ] ] }"
36
], [ -82.7708, 27.47597 ], [ -82.7708, 27.75382 ] ] ] }"
            
37
    }
37
    }
            
38
  ],
38
  ],
            
39
  "groups": [],
39
  "groups": [],
            
40
  "id": "9573563e-aae3-4bf3-8d11-8ddb71100b56",
40
  "id": "9573563e-aae3-4bf3-8d11-8ddb71100b56",
            
41
  "isopen": false,
41
  "isopen": false,
            
42
  "license_id": null,
42
  "license_id": null,
            
43
  "license_title": null,
43
  "license_title": null,
            
44
  "maintainer": "data@disl.org",
44
  "maintainer": "data@disl.org",
            
45
  "maintainer_email": "data@disl.org",
45
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
46
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:04.349435",
46
  "metadata_created": "2022-07-27T14:33:04.349435",
            
n
47
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:04.842735",
n
47
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:05.320706",
            
48
  "name": 
48
  "name": 
            
49
w-water-habitats-around-tampa-bay-in-the-summers-of-2015-andn7x0654x",
49
w-water-habitats-around-tampa-bay-in-the-summers-of-2015-andn7x0654x",
            
50
  "notes": "### Abstract\nSediment oxygen demand and environmental 
50
  "notes": "### Abstract\nSediment oxygen demand and environmental 
            
51
variables were measured with field-deployed metabolism core chambers 
51
variables were measured with field-deployed metabolism core chambers 
            
52
in various sites around the Tampa Bay area in the summers of 2015 and 
52
in various sites around the Tampa Bay area in the summers of 2015 and 
            
53
2016. Each chamber consisted of a 15.24 cm diameter (20.32 cm length) 
53
2016. Each chamber consisted of a 15.24 cm diameter (20.32 cm length) 
            
54
acrylic tube, capped at the top with a custom-built fitting for water 
54
acrylic tube, capped at the top with a custom-built fitting for water 
            
55
stirring and HOBO logger placement. For each chamber deployed, 
55
stirring and HOBO logger placement. For each chamber deployed, 
            
56
dissolved oxygen and water temperature data were collected from within 
56
dissolved oxygen and water temperature data were collected from within 
            
57
the chamber. Light meters were deployed in parallel with the chambers 
57
the chamber. Light meters were deployed in parallel with the chambers 
            
58
to detect ambient light penetration into the water column. From these 
58
to detect ambient light penetration into the water column. From these 
            
59
data, sediment oxygen consumption (mmol O2/m2/day) was calculated. 
59
data, sediment oxygen consumption (mmol O2/m2/day) was calculated. 
            
60
These measurements can be correlated with average temperature, light, 
60
These measurements can be correlated with average temperature, light, 
            
61
time of day, habitat type, site, and sampling year. These data can 
61
time of day, habitat type, site, and sampling year. These data can 
            
62
also be associated with infaunal abundances and characteristics in a 
62
also be associated with infaunal abundances and characteristics in a 
            
63
related Tampa dataset (GRIIDC UDI: R4.x262.000:0015).\n\n### 
63
related Tampa dataset (GRIIDC UDI: R4.x262.000:0015).\n\n### 
            
64
Purpose\nSediment oxygen demand is an aggregate measurement of 
64
Purpose\nSediment oxygen demand is an aggregate measurement of 
            
65
numerous ecosystem functions, including photosynthesis by seagrasses 
65
numerous ecosystem functions, including photosynthesis by seagrasses 
            
66
and benthic microalgae, respiration by a diverse microbial community, 
66
and benthic microalgae, respiration by a diverse microbial community, 
            
67
respiration by meio- and macro-fauna, and enhanced microbial 
67
respiration by meio- and macro-fauna, and enhanced microbial 
            
68
metabolism due to irrigation by macrofauna. We measured sediment 
68
metabolism due to irrigation by macrofauna. We measured sediment 
            
69
oxygen demand at three sites in Tampa Bay, eastern Gulf of Mexico, as 
69
oxygen demand at three sites in Tampa Bay, eastern Gulf of Mexico, as 
            
70
a non-oil-contaminated reference site with which to compare with 
70
a non-oil-contaminated reference site with which to compare with 
            
71
oil-contaminated sites in the Chandeleur Islands (contamination due to 
71
oil-contaminated sites in the Chandeleur Islands (contamination due to 
            
72
the Deep Water Horizon, DWH, oil spill). Oxygen demand was measured 
72
the Deep Water Horizon, DWH, oil spill). Oxygen demand was measured 
            
73
using light and dark custom-built metabolism chambers. Sampling was 
73
using light and dark custom-built metabolism chambers. Sampling was 
            
74
conducted once per year in the summer season (July 2015, June 2016). 
74
conducted once per year in the summer season (July 2015, June 2016). 
            
75
Results are being analyzed for dependence on ambient oxygen 
75
Results are being analyzed for dependence on ambient oxygen 
            
76
concentration, sediment PAH at the 3 sites, annual differences, and 
76
concentration, sediment PAH at the 3 sites, annual differences, and 
            
77
infaunal community biomass. This study aims to provide a 
77
infaunal community biomass. This study aims to provide a 
            
78
non-contaminated reference dataset with which to compare with oiled 
78
non-contaminated reference dataset with which to compare with oiled 
            
79
sites in an effort to assess the impact of oil contamination on 
79
sites in an effort to assess the impact of oil contamination on 
            
80
sediment ecosystem function in the context of natural daily, seasonal, 
80
sediment ecosystem function in the context of natural daily, seasonal, 
            
81
and annual variability in a dynamic ecosystem.\n\n**DOI: 
81
and annual variability in a dynamic ecosystem.\n\n**DOI: 
            
82
[doi:10.7266/N7X0654X](https://www.doi.org/10.7266/N7X0654X)**\n\n### 
82
[doi:10.7266/N7X0654X](https://www.doi.org/10.7266/N7X0654X)**\n\n### 
            
83
Suggested Citation\nSusan Bell. 2017. Sediment oxygen demand in 
83
Suggested Citation\nSusan Bell. 2017. Sediment oxygen demand in 
            
84
shallow water habitats around Tampa Bay in the Summers of 2015 and 
84
shallow water habitats around Tampa Bay in the Summers of 2015 and 
            
85
2016. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative Information 
85
2016. Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative Information 
            
86
and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, Texas A&M 
86
and Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, Texas A&M 
            
87
University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7X0654X\n\n**Funded by:** 
87
University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/N7X0654X\n\n**Funded by:** 
            
88
Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
88
Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
            
89
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
89
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
            
90
(ACER)\n\n",
90
(ACER)\n\n",
            
n
91
  "num_resources": 1,
n
91
  "num_resources": 2,
            
92
  "num_tags": 14,
92
  "num_tags": 14,
            
93
  "organization": {
93
  "organization": {
            
94
    "approval_status": "approved",
94
    "approval_status": "approved",
            
95
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
95
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
96
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
96
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
            
97
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
97
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
98
    "image_url": "",
98
    "image_url": "",
            
99
    "is_organization": true,
99
    "is_organization": true,
            
100
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
100
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
101
    "state": "active",
101
    "state": "active",
            
102
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
102
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
103
    "type": "organization"
103
    "type": "organization"
            
104
  },
104
  },
            
105
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
105
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
106
  "private": false,
106
  "private": false,
            
107
  "relationships_as_object": [],
107
  "relationships_as_object": [],
            
108
  "relationships_as_subject": [],
108
  "relationships_as_subject": [],
            
109
  "resources": [
109
  "resources": [
            
110
    {
110
    {
            
111
      "cache_last_updated": null,
111
      "cache_last_updated": null,
            
112
      "cache_url": null,
112
      "cache_url": null,
            
113
      "created": "2022-07-27T14:33:04.904834",
113
      "created": "2022-07-27T14:33:04.904834",
            
114
      "datastore_active": false,
114
      "datastore_active": false,
            
115
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
115
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
116
      "description": null,
116
      "description": null,
            
117
      "format": "XML",
117
      "format": "XML",
            
118
      "hash": "",
118
      "hash": "",
            
119
      "id": "926b8326-e982-493e-b30c-48bc58d4a07f",
119
      "id": "926b8326-e982-493e-b30c-48bc58d4a07f",
            
120
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:04.829805",
120
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:04.829805",
            
n
121
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:04.849019",
n
121
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:05.325960",
            
122
      "mimetype": "application/xml",
122
      "mimetype": "application/xml",
            
123
      "mimetype_inner": null,
123
      "mimetype_inner": null,
            
124
      "name": "R4.x262.000-0009-metadata.xml",
124
      "name": "R4.x262.000-0009-metadata.xml",
            
125
      "package_id": "9573563e-aae3-4bf3-8d11-8ddb71100b56",
125
      "package_id": "9573563e-aae3-4bf3-8d11-8ddb71100b56",
            
126
      "position": 0,
126
      "position": 0,
            
127
      "resource_type": null,
127
      "resource_type": null,
            
128
      "size": 33438,
128
      "size": 33438,
            
129
      "state": "active",
129
      "state": "active",
            
130
      "url": 
130
      "url": 
            
131
6-e982-493e-b30c-48bc58d4a07f/download/r4.x262.000-0009-metadata.xml",
131
6-e982-493e-b30c-48bc58d4a07f/download/r4.x262.000-0009-metadata.xml",
            
t
t
132
      "url_type": "upload"
            
133
    },
            
134
    {
            
135
      "cache_last_updated": null,
            
136
      "cache_url": null,
            
137
      "created": "2022-07-27T14:33:05.378899",
            
138
      "datastore_active": false,
            
139
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
140
      "description": null,
            
141
      "format": "CSV",
            
142
      "hash": "",
            
143
      "id": "aa312932-062d-4149-a011-cd4969881bea",
            
144
      "last_modified": "2022-07-27T14:33:05.307810",
            
145
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:33:05.326335",
            
146
      "mimetype": "text/csv",
            
147
      "mimetype_inner": null,
            
148
      "name": "sediment_oxygen_demand_Tampa_2015_2016_data.csv",
            
149
      "package_id": "9573563e-aae3-4bf3-8d11-8ddb71100b56",
            
150
      "position": 1,
            
151
      "resource_type": null,
            
152
      "size": 10603,
            
153
      "state": "active",
            
154
      "url": 
            
155
d4969881bea/download/sediment_oxygen_demand_tampa_2015_2016_data.csv",
            
132
      "url_type": "upload"
156
      "url_type": "upload"
            
133
    }
157
    }
            
134
  ],
158
  ],
            
135
  "state": "active",
159
  "state": "active",
            
136
  "tags": [
160
  "tags": [
            
137
    {
161
    {
            
138
      "display_name": "DO",
162
      "display_name": "DO",
            
139
      "id": "32dbf418-8bec-4c18-9eff-6bc514b1233d",
163
      "id": "32dbf418-8bec-4c18-9eff-6bc514b1233d",
            
140
      "name": "DO",
164
      "name": "DO",
            
141
      "state": "active",
165
      "state": "active",
            
142
      "vocabulary_id": null
166
      "vocabulary_id": null
            
143
    },
167
    },
            
144
    {
168
    {
            
145
      "display_name": "Fort De Soto",
169
      "display_name": "Fort De Soto",
            
146
      "id": "c6d9a26f-1521-4b0a-a98e-c982a4494785",
170
      "id": "c6d9a26f-1521-4b0a-a98e-c982a4494785",
            
147
      "name": "Fort De Soto",
171
      "name": "Fort De Soto",
            
148
      "state": "active",
172
      "state": "active",
            
149
      "vocabulary_id": null
173
      "vocabulary_id": null
            
150
    },
174
    },
            
151
    {
175
    {
            
152
      "display_name": "Lassing Park",
176
      "display_name": "Lassing Park",
            
153
      "id": "7d955870-5696-4c36-a376-3855e2f6fa5b",
177
      "id": "7d955870-5696-4c36-a376-3855e2f6fa5b",
            
154
      "name": "Lassing Park",
178
      "name": "Lassing Park",
            
155
      "state": "active",
179
      "state": "active",
            
156
      "vocabulary_id": null
180
      "vocabulary_id": null
            
157
    },
181
    },
            
158
    {
182
    {
            
159
      "display_name": "Tampa Bay",
183
      "display_name": "Tampa Bay",
            
160
      "id": "fdd3f9a3-8d7d-4941-99df-d871a2b8e7ca",
184
      "id": "fdd3f9a3-8d7d-4941-99df-d871a2b8e7ca",
            
161
      "name": "Tampa Bay",
185
      "name": "Tampa Bay",
            
162
      "state": "active",
186
      "state": "active",
            
163
      "vocabulary_id": null
187
      "vocabulary_id": null
            
164
    },
188
    },
            
165
    {
189
    {
            
166
      "display_name": "War Memorial Park",
190
      "display_name": "War Memorial Park",
            
167
      "id": "5eb6dba9-588e-4843-a91a-95e0086f0a73",
191
      "id": "5eb6dba9-588e-4843-a91a-95e0086f0a73",
            
168
      "name": "War Memorial Park",
192
      "name": "War Memorial Park",
            
169
      "state": "active",
193
      "state": "active",
            
170
      "vocabulary_id": null
194
      "vocabulary_id": null
            
171
    },
195
    },
            
172
    {
196
    {
            
173
      "display_name": "dissolved oxygen",
197
      "display_name": "dissolved oxygen",
            
174
      "id": "e2f6c9b6-190d-4eeb-93ca-562e8802eb62",
198
      "id": "e2f6c9b6-190d-4eeb-93ca-562e8802eb62",
            
175
      "name": "dissolved oxygen",
199
      "name": "dissolved oxygen",
            
176
      "state": "active",
200
      "state": "active",
            
177
      "vocabulary_id": null
201
      "vocabulary_id": null
            
178
    },
202
    },
            
179
    {
203
    {
            
180
      "display_name": "infauna",
204
      "display_name": "infauna",
            
181
      "id": "31fdce84-372e-4cba-a1f4-c8afa5ef5bc0",
205
      "id": "31fdce84-372e-4cba-a1f4-c8afa5ef5bc0",
            
182
      "name": "infauna",
206
      "name": "infauna",
            
183
      "state": "active",
207
      "state": "active",
            
184
      "vocabulary_id": null
208
      "vocabulary_id": null
            
185
    },
209
    },
            
186
    {
210
    {
            
187
      "display_name": "metabolism",
211
      "display_name": "metabolism",
            
188
      "id": "b557ebae-bec3-4531-8b68-7e420d152e9c",
212
      "id": "b557ebae-bec3-4531-8b68-7e420d152e9c",
            
189
      "name": "metabolism",
213
      "name": "metabolism",
            
190
      "state": "active",
214
      "state": "active",
            
191
      "vocabulary_id": null
215
      "vocabulary_id": null
            
192
    },
216
    },
            
193
    {
217
    {
            
194
      "display_name": "oxygen consumption",
218
      "display_name": "oxygen consumption",
            
195
      "id": "b6aa7e72-c5e8-4923-81ef-689195f48aae",
219
      "id": "b6aa7e72-c5e8-4923-81ef-689195f48aae",
            
196
      "name": "oxygen consumption",
220
      "name": "oxygen consumption",
            
197
      "state": "active",
221
      "state": "active",
            
198
      "vocabulary_id": null
222
      "vocabulary_id": null
            
199
    },
223
    },
            
200
    {
224
    {
            
201
      "display_name": "photosynthesis",
225
      "display_name": "photosynthesis",
            
202
      "id": "2d5e6276-7e8b-4592-bd96-bf5d740a986c",
226
      "id": "2d5e6276-7e8b-4592-bd96-bf5d740a986c",
            
203
      "name": "photosynthesis",
227
      "name": "photosynthesis",
            
204
      "state": "active",
228
      "state": "active",
            
205
      "vocabulary_id": null
229
      "vocabulary_id": null
            
206
    },
230
    },
            
207
    {
231
    {
            
208
      "display_name": "respiration",
232
      "display_name": "respiration",
            
209
      "id": "58a9960a-0275-46de-8829-658653b02cbe",
233
      "id": "58a9960a-0275-46de-8829-658653b02cbe",
            
210
      "name": "respiration",
234
      "name": "respiration",
            
211
      "state": "active",
235
      "state": "active",
            
212
      "vocabulary_id": null
236
      "vocabulary_id": null
            
213
    },
237
    },
            
214
    {
238
    {
            
215
      "display_name": "seagrass",
239
      "display_name": "seagrass",
            
216
      "id": "5824ced6-3e9f-41c8-abac-b98bcff0e203",
240
      "id": "5824ced6-3e9f-41c8-abac-b98bcff0e203",
            
217
      "name": "seagrass",
241
      "name": "seagrass",
            
218
      "state": "active",
242
      "state": "active",
            
219
      "vocabulary_id": null
243
      "vocabulary_id": null
            
220
    },
244
    },
            
221
    {
245
    {
            
222
      "display_name": "sediment",
246
      "display_name": "sediment",
            
223
      "id": "d786ab28-d532-4342-a122-d99565e6d8ce",
247
      "id": "d786ab28-d532-4342-a122-d99565e6d8ce",
            
224
      "name": "sediment",
248
      "name": "sediment",
            
225
      "state": "active",
249
      "state": "active",
            
226
      "vocabulary_id": null
250
      "vocabulary_id": null
            
227
    },
251
    },
            
228
    {
252
    {
            
229
      "display_name": "temperature",
253
      "display_name": "temperature",
            
230
      "id": "bd49751d-657b-49b8-9c24-93d8c25ad0a1",
254
      "id": "bd49751d-657b-49b8-9c24-93d8c25ad0a1",
            
231
      "name": "temperature",
255
      "name": "temperature",
            
232
      "state": "active",
256
      "state": "active",
            
233
      "vocabulary_id": null
257
      "vocabulary_id": null
            
234
    }
258
    }
            
235
  ],
259
  ],
            
236
  "title": "Sediment oxygen demand in shallow water habitats around 
260
  "title": "Sediment oxygen demand in shallow water habitats around 
            
237
Tampa Bay in the Summers of 2015 and 2016",
261
Tampa Bay in the Summers of 2015 and 2016",
            
238
  "type": "dataset",
262
  "type": "dataset",
            
239
  "url": null,
263
  "url": null,
            
240
  "version": null
264
  "version": null
            
241
}
265
}