Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Frank Hernandez",
2
  "author": "Frank Hernandez",
            
3
  "author_email": "frank.hernandez@usm.edu",
3
  "author_email": "frank.hernandez@usm.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "Access_Constraints",
7
      "key": "Access_Constraints",
            
8
      "value": "Permission to access these data must be given by Frank 
8
      "value": "Permission to access these data must be given by Frank 
            
9
Hernandez or Keith Bayha."
9
Hernandez or Keith Bayha."
            
10
    },
10
    },
            
11
    {
11
    {
            
12
      "key": "ISO 19115 Topic Categories",
12
      "key": "ISO 19115 Topic Categories",
            
13
      "value": "oceans, biota"
13
      "value": "oceans, biota"
            
14
    },
14
    },
            
15
    {
15
    {
            
16
      "key": "Place Keywords",
16
      "key": "Place Keywords",
            
17
      "value": "Gulf of Mexico"
17
      "value": "Gulf of Mexico"
            
18
    },
18
    },
            
19
    {
19
    {
            
20
      "key": "Theme Keywords",
20
      "key": "Theme Keywords",
            
21
      "value": "Gulf of Mexico, DNA sequences, COI, Cytb, 16S, 
21
      "value": "Gulf of Mexico, DNA sequences, COI, Cytb, 16S, 
            
22
GenBank, FishBase, Barcode of Life Data Systems, voucher collection"
22
GenBank, FishBase, Barcode of Life Data Systems, voucher collection"
            
23
    },
23
    },
            
24
    {
24
    {
            
25
      "key": "Use_Constraints",
25
      "key": "Use_Constraints",
            
26
      "value": "Acknowledgment of Dauphin Island Sea Lab's FOCAL Lab 
26
      "value": "Acknowledgment of Dauphin Island Sea Lab's FOCAL Lab 
            
27
is required in products developed from these data, and such 
27
is required in products developed from these data, and such 
            
28
acknowledgment as is standard for citation and legal practices for 
28
acknowledgment as is standard for citation and legal practices for 
            
29
data source is expected by users of these data. Users should be aware 
29
data source is expected by users of these data. Users should be aware 
            
30
that comparison with other data sets for the same area from other time 
30
that comparison with other data sets for the same area from other time 
            
31
periods may be inaccurate due to inconsistencies resulting from 
31
periods may be inaccurate due to inconsistencies resulting from 
            
32
changes in mapping conventions, data collection, and computer 
32
changes in mapping conventions, data collection, and computer 
            
33
processes over time. The distributor shall not be liable for improper 
33
processes over time. The distributor shall not be liable for improper 
            
34
or incorrect use of these data, based on the description of 
34
or incorrect use of these data, based on the description of 
            
35
appropriate/inappropriate uses described in the metadata document. 
35
appropriate/inappropriate uses described in the metadata document. 
            
36
These data are not legal documents and are not to be used as such."
36
These data are not legal documents and are not to be used as such."
            
37
    },
37
    },
            
38
    {
38
    {
            
39
      "key": "dc.contributor",
39
      "key": "dc.contributor",
            
40
      "value": "DISL: FOCAL Lab"
40
      "value": "DISL: FOCAL Lab"
            
41
    },
41
    },
            
42
    {
42
    {
            
43
      "key": "dc.coverage.placeName",
43
      "key": "dc.coverage.placeName",
            
44
      "value": "Gulf of Mexico"
44
      "value": "Gulf of Mexico"
            
45
    },
45
    },
            
46
    {
46
    {
            
47
      "key": "dc.coverage.t.max",
47
      "key": "dc.coverage.t.max",
            
48
      "value": "2010T"
48
      "value": "2010T"
            
49
    },
49
    },
            
50
    {
50
    {
            
51
      "key": "dc.coverage.t.min",
51
      "key": "dc.coverage.t.min",
            
52
      "value": "2010T"
52
      "value": "2010T"
            
53
    },
53
    },
            
54
    {
54
    {
            
55
      "key": "dc.coverage.x.max",
55
      "key": "dc.coverage.x.max",
            
56
      "value": "-87.59"
56
      "value": "-87.59"
            
57
    },
57
    },
            
58
    {
58
    {
            
59
      "key": "dc.coverage.x.min",
59
      "key": "dc.coverage.x.min",
            
60
      "value": "-88.31"
60
      "value": "-88.31"
            
61
    },
61
    },
            
62
    {
62
    {
            
63
      "key": "dc.coverage.y.max",
63
      "key": "dc.coverage.y.max",
            
64
      "value": "30.66"
64
      "value": "30.66"
            
65
    },
65
    },
            
66
    {
66
    {
            
67
      "key": "dc.coverage.y.min",
67
      "key": "dc.coverage.y.min",
            
68
      "value": "30.04"
68
      "value": "30.04"
            
69
    },
69
    },
            
70
    {
70
    {
            
71
      "key": "dc.creator",
71
      "key": "dc.creator",
            
72
      "value": "Dauphin Island Sea Lab's (DISL): FOCAL Lab"
72
      "value": "Dauphin Island Sea Lab's (DISL): FOCAL Lab"
            
73
    },
73
    },
            
74
    {
74
    {
            
75
      "key": "dc.date",
75
      "key": "dc.date",
            
76
      "value": "Unpublished material"
76
      "value": "Unpublished material"
            
77
    },
77
    },
            
78
    {
78
    {
            
79
      "key": "dc.description",
79
      "key": "dc.description",
            
80
      "value": "In 2010 the Dauphin Island Sea Lab (DISL) began 
80
      "value": "In 2010 the Dauphin Island Sea Lab (DISL) began 
            
81
construction on an extensive database of Gulf of Mexico fish species 
81
construction on an extensive database of Gulf of Mexico fish species 
            
82
and the genetic information available for each. Due to the 
82
and the genetic information available for each. Due to the 
            
83
impossibility of identifying fish eggs through morphological 
83
impossibility of identifying fish eggs through morphological 
            
84
characteristics, the only accurate method of identification is through 
84
characteristics, the only accurate method of identification is through 
            
85
molecular analysis. Real-time PCR makes it possible to identify the 
85
molecular analysis. Real-time PCR makes it possible to identify the 
            
86
species of eggs cheaply, efficiently, and in-house; however, this 
86
species of eggs cheaply, efficiently, and in-house; however, this 
            
87
methodology requires an extensive amount of genetic data that must be 
87
methodology requires an extensive amount of genetic data that must be 
            
88
adequately organized to be manageable. This information is organized 
88
adequately organized to be manageable. This information is organized 
            
89
in a database with publicly available information found in Barcode of 
89
in a database with publicly available information found in Barcode of 
            
90
Life Data Systems, GenBank, and FishBase. The database serves to 
90
Life Data Systems, GenBank, and FishBase. The database serves to 
            
91
identify what Gulf of Mexico species are missing from public databases 
91
identify what Gulf of Mexico species are missing from public databases 
            
92
and need to be collected. This database will be complemented by a 
92
and need to be collected. This database will be complemented by a 
            
93
voucher collection including three to five specimens of each species, 
93
voucher collection including three to five specimens of each species, 
            
94
to be analyzed genetically and preserved for museum use. The creation 
94
to be analyzed genetically and preserved for museum use. The creation 
            
95
of this database is the start of an ongoing process of collecting and 
95
of this database is the start of an ongoing process of collecting and 
            
96
preserving specimens for the in-house genetic library."
96
preserving specimens for the in-house genetic library."
            
97
    },
97
    },
            
98
    {
98
    {
            
99
      "key": "dc.language",
99
      "key": "dc.language",
            
100
      "value": "en"
100
      "value": "en"
            
101
    },
101
    },
            
102
    {
102
    {
            
103
      "key": "dc.subject",
103
      "key": "dc.subject",
            
104
      "value": "Gulf of Mexico DNA sequences COI Cytb 16S GenBank 
104
      "value": "Gulf of Mexico DNA sequences COI Cytb 16S GenBank 
            
105
FishBase Barcode of Life Data Systems voucher collection"
105
FishBase Barcode of Life Data Systems voucher collection"
            
106
    },
106
    },
            
107
    {
107
    {
            
108
      "key": "dc.title",
108
      "key": "dc.title",
            
109
      "value": "Development of a Marine Fish Archive and Molecular 
109
      "value": "Development of a Marine Fish Archive and Molecular 
            
110
Database for the Identification of Ichthyoplankton in the Northern 
110
Database for the Identification of Ichthyoplankton in the Northern 
            
111
Gulf of Mexico (2010)"
111
Gulf of Mexico (2010)"
            
112
    },
112
    },
            
113
    {
113
    {
            
114
      "key": "dc.type",
114
      "key": "dc.type",
            
115
      "value": "spreadsheet"
115
      "value": "spreadsheet"
            
116
    },
116
    },
            
117
    {
117
    {
            
118
      "key": "spatial",
118
      "key": "spatial",
            
119
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
119
      "value": "{ \"type\": \"Polygon\", \"coordinates\": [ [ [ 
            
120
-88.31, 30.66 ], [ -87.59, 30.66 ], [ -87.59, 30.04 ], [ -88.31, 30.04 
120
-88.31, 30.66 ], [ -87.59, 30.66 ], [ -87.59, 30.04 ], [ -88.31, 30.04 
            
121
], [ -88.31, 30.66 ] ] ] }"
121
], [ -88.31, 30.66 ] ] ] }"
            
122
    }
122
    }
            
123
  ],
123
  ],
            
124
  "groups": [],
124
  "groups": [],
            
125
  "id": "061d9f5f-80c8-4079-9a52-41ff9cef17fe",
125
  "id": "061d9f5f-80c8-4079-9a52-41ff9cef17fe",
            
126
  "isopen": false,
126
  "isopen": false,
            
127
  "license_id": null,
127
  "license_id": null,
            
128
  "license_title": null,
128
  "license_title": null,
            
129
  "maintainer": "data@disl.org",
129
  "maintainer": "data@disl.org",
            
130
  "maintainer_email": "data@disl.org",
130
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
131
  "metadata_created": "2022-07-23T03:04:29.975859",
131
  "metadata_created": "2022-07-23T03:04:29.975859",
            
n
132
  "metadata_modified": "2022-07-23T03:04:29.975872",
n
132
  "metadata_modified": "2022-07-23T03:04:31.098010",
            
133
  "name": 
133
  "name": 
            
134
hive-and-molecular-database-for-the-identification-of-ichthyoplankto",
134
hive-and-molecular-database-for-the-identification-of-ichthyoplankto",
            
135
  "notes": "In 2010 the Dauphin Island Sea Lab (DISL) began 
135
  "notes": "In 2010 the Dauphin Island Sea Lab (DISL) began 
            
136
construction on an extensive database of Gulf of Mexico fish species 
136
construction on an extensive database of Gulf of Mexico fish species 
            
137
and the genetic information available for each. Due to the 
137
and the genetic information available for each. Due to the 
            
138
impossibility of identifying fish eggs through morphological 
138
impossibility of identifying fish eggs through morphological 
            
139
characteristics, the only accurate method of identification is through 
139
characteristics, the only accurate method of identification is through 
            
140
molecular analysis. Real-time PCR makes it possible to identify the 
140
molecular analysis. Real-time PCR makes it possible to identify the 
            
141
species of eggs cheaply, efficiently, and in-house; however, this 
141
species of eggs cheaply, efficiently, and in-house; however, this 
            
142
methodology requires an extensive amount of genetic data that must be 
142
methodology requires an extensive amount of genetic data that must be 
            
143
adequately organized to be manageable. This information is organized 
143
adequately organized to be manageable. This information is organized 
            
144
in a database with publicly available information found in Barcode of 
144
in a database with publicly available information found in Barcode of 
            
145
Life Data Systems, GenBank, and FishBase. The database serves to 
145
Life Data Systems, GenBank, and FishBase. The database serves to 
            
146
identify what Gulf of Mexico species are missing from public databases 
146
identify what Gulf of Mexico species are missing from public databases 
            
147
and need to be collected. This database will be complemented by a 
147
and need to be collected. This database will be complemented by a 
            
148
voucher collection including three to five specimens of each species, 
148
voucher collection including three to five specimens of each species, 
            
149
to be analyzed genetically and preserved for museum use. The creation 
149
to be analyzed genetically and preserved for museum use. The creation 
            
150
of this database is the start of an ongoing process of collecting and 
150
of this database is the start of an ongoing process of collecting and 
            
151
preserving specimens for the in-house genetic library.",
151
preserving specimens for the in-house genetic library.",
            
n
152
  "num_resources": 0,
n
152
  "num_resources": 1,
            
153
  "num_tags": 11,
153
  "num_tags": 11,
            
154
  "organization": {
154
  "organization": {
            
155
    "approval_status": "approved",
155
    "approval_status": "approved",
            
156
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
156
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
157
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
157
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
            
158
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
158
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
159
    "image_url": "",
159
    "image_url": "",
            
160
    "is_organization": true,
160
    "is_organization": true,
            
161
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
161
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
162
    "state": "active",
162
    "state": "active",
            
163
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
163
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
164
    "type": "organization"
164
    "type": "organization"
            
165
  },
165
  },
            
166
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
166
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
167
  "private": false,
167
  "private": false,
            
168
  "relationships_as_object": [],
168
  "relationships_as_object": [],
            
169
  "relationships_as_subject": [],
169
  "relationships_as_subject": [],
            
t
170
  "resources": [],
t
170
  "resources": [
            
171
    {
            
172
      "cache_last_updated": null,
            
173
      "cache_url": null,
            
174
      "created": "2022-07-23T03:04:31.169559",
            
175
      "datastore_active": false,
            
176
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
177
      "description": null,
            
178
      "format": "HTML",
            
179
      "hash": "",
            
180
      "id": "a3c2d022-4076-456e-8036-460c81b69aad",
            
181
      "last_modified": "2022-07-23T03:04:31.069174",
            
182
      "metadata_modified": "2022-07-23T03:04:31.106469",
            
183
      "mimetype": "text/html",
            
184
      "mimetype_inner": null,
            
185
      "name": "35.html",
            
186
      "package_id": "061d9f5f-80c8-4079-9a52-41ff9cef17fe",
            
187
      "position": 0,
            
188
      "resource_type": null,
            
189
      "size": 322298,
            
190
      "state": "active",
            
191
      "url": 
            
192
f17fe/resource/a3c2d022-4076-456e-8036-460c81b69aad/download/35.html",
            
193
      "url_type": "upload"
            
194
    }
            
195
  ],
            
171
  "state": "active",
196
  "state": "active",
            
172
  "tags": [
197
  "tags": [
            
173
    {
198
    {
            
174
      "display_name": "16S",
199
      "display_name": "16S",
            
175
      "id": "566b1982-e343-4cc3-a786-78845cde0356",
200
      "id": "566b1982-e343-4cc3-a786-78845cde0356",
            
176
      "name": "16S",
201
      "name": "16S",
            
177
      "state": "active",
202
      "state": "active",
            
178
      "vocabulary_id": null
203
      "vocabulary_id": null
            
179
    },
204
    },
            
180
    {
205
    {
            
181
      "display_name": "Barcode of Life Data Systems",
206
      "display_name": "Barcode of Life Data Systems",
            
182
      "id": "cec914b9-47ff-49f8-9032-4e60738f6d38",
207
      "id": "cec914b9-47ff-49f8-9032-4e60738f6d38",
            
183
      "name": "Barcode of Life Data Systems",
208
      "name": "Barcode of Life Data Systems",
            
184
      "state": "active",
209
      "state": "active",
            
185
      "vocabulary_id": null
210
      "vocabulary_id": null
            
186
    },
211
    },
            
187
    {
212
    {
            
188
      "display_name": "COI",
213
      "display_name": "COI",
            
189
      "id": "60f24f4a-ab75-44ba-8162-00168b677884",
214
      "id": "60f24f4a-ab75-44ba-8162-00168b677884",
            
190
      "name": "COI",
215
      "name": "COI",
            
191
      "state": "active",
216
      "state": "active",
            
192
      "vocabulary_id": null
217
      "vocabulary_id": null
            
193
    },
218
    },
            
194
    {
219
    {
            
195
      "display_name": "Cytb",
220
      "display_name": "Cytb",
            
196
      "id": "05d227be-4da3-4689-8d69-3e2316dbaf40",
221
      "id": "05d227be-4da3-4689-8d69-3e2316dbaf40",
            
197
      "name": "Cytb",
222
      "name": "Cytb",
            
198
      "state": "active",
223
      "state": "active",
            
199
      "vocabulary_id": null
224
      "vocabulary_id": null
            
200
    },
225
    },
            
201
    {
226
    {
            
202
      "display_name": "DNA sequences",
227
      "display_name": "DNA sequences",
            
203
      "id": "39847059-f7b4-4278-a292-cfcdec8d7678",
228
      "id": "39847059-f7b4-4278-a292-cfcdec8d7678",
            
204
      "name": "DNA sequences",
229
      "name": "DNA sequences",
            
205
      "state": "active",
230
      "state": "active",
            
206
      "vocabulary_id": null
231
      "vocabulary_id": null
            
207
    },
232
    },
            
208
    {
233
    {
            
209
      "display_name": "FishBase",
234
      "display_name": "FishBase",
            
210
      "id": "9a3a8f21-40b6-4ff2-819a-446f9e6a5d0d",
235
      "id": "9a3a8f21-40b6-4ff2-819a-446f9e6a5d0d",
            
211
      "name": "FishBase",
236
      "name": "FishBase",
            
212
      "state": "active",
237
      "state": "active",
            
213
      "vocabulary_id": null
238
      "vocabulary_id": null
            
214
    },
239
    },
            
215
    {
240
    {
            
216
      "display_name": "GenBank",
241
      "display_name": "GenBank",
            
217
      "id": "2e554af1-edde-4642-850d-b7ab2e547002",
242
      "id": "2e554af1-edde-4642-850d-b7ab2e547002",
            
218
      "name": "GenBank",
243
      "name": "GenBank",
            
219
      "state": "active",
244
      "state": "active",
            
220
      "vocabulary_id": null
245
      "vocabulary_id": null
            
221
    },
246
    },
            
222
    {
247
    {
            
223
      "display_name": "Gulf of Mexico",
248
      "display_name": "Gulf of Mexico",
            
224
      "id": "26b2a6bc-e01b-4c22-9d3f-5bbcd148cc4f",
249
      "id": "26b2a6bc-e01b-4c22-9d3f-5bbcd148cc4f",
            
225
      "name": "Gulf of Mexico",
250
      "name": "Gulf of Mexico",
            
226
      "state": "active",
251
      "state": "active",
            
227
      "vocabulary_id": null
252
      "vocabulary_id": null
            
228
    },
253
    },
            
229
    {
254
    {
            
230
      "display_name": "biota",
255
      "display_name": "biota",
            
231
      "id": "8697f957-08f7-4539-8025-fcb58cb28994",
256
      "id": "8697f957-08f7-4539-8025-fcb58cb28994",
            
232
      "name": "biota",
257
      "name": "biota",
            
233
      "state": "active",
258
      "state": "active",
            
234
      "vocabulary_id": null
259
      "vocabulary_id": null
            
235
    },
260
    },
            
236
    {
261
    {
            
237
      "display_name": "oceans",
262
      "display_name": "oceans",
            
238
      "id": "a6963a6f-1b79-4724-a263-d5f1bebec382",
263
      "id": "a6963a6f-1b79-4724-a263-d5f1bebec382",
            
239
      "name": "oceans",
264
      "name": "oceans",
            
240
      "state": "active",
265
      "state": "active",
            
241
      "vocabulary_id": null
266
      "vocabulary_id": null
            
242
    },
267
    },
            
243
    {
268
    {
            
244
      "display_name": "voucher collection",
269
      "display_name": "voucher collection",
            
245
      "id": "04a3e76c-4afd-47d7-a427-6a26e103c9a3",
270
      "id": "04a3e76c-4afd-47d7-a427-6a26e103c9a3",
            
246
      "name": "voucher collection",
271
      "name": "voucher collection",
            
247
      "state": "active",
272
      "state": "active",
            
248
      "vocabulary_id": null
273
      "vocabulary_id": null
            
249
    }
274
    }
            
250
  ],
275
  ],
            
251
  "title": "Development of a Marine Fish Archive and Molecular 
276
  "title": "Development of a Marine Fish Archive and Molecular 
            
252
Database for the Identification of Ichthyoplankton in the Northern 
277
Database for the Identification of Ichthyoplankton in the Northern 
            
253
Gulf of Mexico (2010)",
278
Gulf of Mexico (2010)",
            
254
  "type": "dataset",
279
  "type": "dataset",
            
255
  "url": null,
280
  "url": null,
            
256
  "version": null
281
  "version": null
            
257
}
282
}