Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Hidetoshi Urakawa",
2
  "author": "Hidetoshi Urakawa",
            
3
  "author_email": "hurakawa@fgcu.edu",
3
  "author_email": "hurakawa@fgcu.edu",
            
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
4
  "creator_user_id": "851c91e4-6343-45af-967a-20a33797707e",
            
5
  "extras": [
5
  "extras": [
            
6
    {
6
    {
            
7
      "key": "DOI",
7
      "key": "DOI",
            
8
      "value": "doi:10.7266/2KJXRNCG"
8
      "value": "doi:10.7266/2KJXRNCG"
            
9
    },
9
    },
            
10
    {
10
    {
            
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
11
      "key": "ISO.pointOfContact",
            
12
      "value": "Hidetoshi Urakawa <hurakawa@fgcu.edu>"
12
      "value": "Hidetoshi Urakawa <hurakawa@fgcu.edu>"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "key": "Theme Keywords",
15
      "key": "Theme Keywords",
            
16
      "value": "The Deepwater Horizon oil spill, tidal flat, benthic 
16
      "value": "The Deepwater Horizon oil spill, tidal flat, benthic 
            
17
algae, diatoms, Microcosm, Metagenomic, Sediment metagenome"
17
algae, diatoms, Microcosm, Metagenomic, Sediment metagenome"
            
18
    }
18
    }
            
19
  ],
19
  ],
            
20
  "groups": [],
20
  "groups": [],
            
21
  "id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
21
  "id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
            
22
  "isopen": false,
22
  "isopen": false,
            
23
  "license_id": null,
23
  "license_id": null,
            
24
  "license_title": null,
24
  "license_title": null,
            
25
  "maintainer": "data@disl.org",
25
  "maintainer": "data@disl.org",
            
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
26
  "maintainer_email": "data@disl.org",
            
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:44.080533",
27
  "metadata_created": "2022-07-27T14:34:44.080533",
            
n
28
  "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:17.388536",
n
28
  "metadata_modified": "2022-10-10T21:20:09.886010",
            
29
  "name": 
29
  "name": 
            
30
microelectrode-profile-responses-in-oiled-coastal-marine-sed2kjxrncg",
30
microelectrode-profile-responses-in-oiled-coastal-marine-sed2kjxrncg",
            
31
  "notes": "### Abstract\nThe Deepwater Horizon oil spill impacted 
31
  "notes": "### Abstract\nThe Deepwater Horizon oil spill impacted 
            
32
tidal flats in the Gulf of Mexico. This collection of datasets is 
32
tidal flats in the Gulf of Mexico. This collection of datasets is 
            
33
generated from oiled tidal flat microcosms to examine the oil spill 
33
generated from oiled tidal flat microcosms to examine the oil spill 
            
34
responses on benthic algal communities. Genomic DNA was extracted from 
34
responses on benthic algal communities. Genomic DNA was extracted from 
            
35
the surface sediment cores. The abundance and biodiversity of 
35
the surface sediment cores. The abundance and biodiversity of 
            
36
microphytobenthic communities were characterized based on the 23S rRNA 
36
microphytobenthic communities were characterized based on the 23S rRNA 
            
37
gene using Illumina MiSeq 2x 250 bp technology. Research background 
37
gene using Illumina MiSeq 2x 250 bp technology. Research background 
            
38
and DNA sequence data can be accessed at the National Center for 
38
and DNA sequence data can be accessed at the National Center for 
            
39
Biotechnology Information (NCBI) under accession number 
39
Biotechnology Information (NCBI) under accession number 
            
40
PRJNA631343.\n\n### Purpose\nShared research information and DNA 
40
PRJNA631343.\n\n### Purpose\nShared research information and DNA 
            
41
sequences can be used as references by other researchers who study 
41
sequences can be used as references by other researchers who study 
            
42
oiling effects on benthic algal communities.\n\n**DOI: 
42
oiling effects on benthic algal communities.\n\n**DOI: 
            
43
[doi:10.7266/2KJXRNCG](https://www.doi.org/10.7266/2KJXRNCG)**\n\n### 
43
[doi:10.7266/2KJXRNCG](https://www.doi.org/10.7266/2KJXRNCG)**\n\n### 
            
44
Suggested Citation\nHidetoshi Urakawa and Megan F. Feeney. 2020. 
44
Suggested Citation\nHidetoshi Urakawa and Megan F. Feeney. 2020. 
            
45
Microphytobenthic community and microelectrode profile responses in 
45
Microphytobenthic community and microelectrode profile responses in 
            
46
oiled coastal marine sediment microcosms, based on samples collected 
46
oiled coastal marine sediment microcosms, based on samples collected 
            
47
at Chandeleur Island, Louisiana and Estero Bay, Florida in 2017. 
47
at Chandeleur Island, Louisiana and Estero Bay, Florida in 2017. 
            
48
Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative Information and 
48
Distributed by: Gulf of Mexico Research Initiative Information and 
            
49
Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, Texas A&M 
49
Data Cooperative (GRIIDC), Harte Research Institute, Texas A&M 
            
50
University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/2KJXRNCG\n\n**Funded by:** 
50
University\u2013Corpus Christi. doi:10.7266/2KJXRNCG\n\n**Funded by:** 
            
51
Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
51
Gulf of Mexico Research Initiative (GoMRI)\n\n**Funding cycle:** 
            
52
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
52
RFP-IV\n\n**Research group:** Alabama Center for Ecological Resilience 
            
53
(ACER)\n\n",
53
(ACER)\n\n",
            
54
  "num_resources": 2,
54
  "num_resources": 2,
            
n
55
  "num_tags": 7,
n
55
  "num_tags": 0,
            
56
  "organization": {
56
  "organization": {
            
57
    "approval_status": "approved",
57
    "approval_status": "approved",
            
58
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
58
    "created": "2022-07-22T03:25:13.329710",
            
n
59
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab organization.",
n
59
    "description": "The Dauphin Island Sea Lab's (DISL) mission is to 
            
60
become a center for transformative U.S. oceanic and coastal research 
            
61
and education.. Founded in 1971 by the State of Alabama Legislature to 
            
62
maximize the marine sciences capabilities of several Alabama 
            
63
institutions and minimize duplication. \r\n\r\nLocated on the eastern 
            
64
tip of Dauphin Island, a barrier island in the northern Gulf of 
            
65
Mexico, DISL is surrounded by Mobile Bay, the Mississippi Sound, and 
            
66
the waters of the Gulf, making it a perfect location to conduct a wide 
            
67
range of marine science activity. \r\n\r\n[The University Programs 
            
68
(UP)](https://www.disl.edu/univ-prog/) serves the students of the 
            
69
Marine Environmental Sciences Consortium\u2019s (MESC) 22 public and 
            
70
private four-year colleges and universities through graduate and 
            
71
undergraduate programs. Throughout the year, graduate students conduct 
            
72
research, and attend classes while completing their degree under the 
            
73
mentorship of faculty and staff at the Dauphin Island Sea Lab.  
            
74
\r\n\r\n[The Discovery Hall Programs (DHP)](https://www.disl.edu/dhp/) 
            
75
oversees educational programs for K-12 field programs, 
            
76
teacher-training, and community outreach opportunities.  \r\n[The 
            
77
Estuarium](https://www.disl.edu/aquarium/), our public aquarium 
            
78
located on the Dauphin Island Sea Lab campus, is a part of DHP's 
            
79
educational outreach mission. The Estuarium focuses solely on the 
            
80
Mobile-Tensaw Estuary System. The BayMobile allows DHP educators to 
            
81
bring marine science to students across Alabama in the classroom and 
            
82
at community events. \r\n\r\nResearch programs at the Dauphin Island 
            
83
Sea Lab range from biogeochemistry and oceanography to ecosystem 
            
84
ecology. While much of our research focuses on the near-shore and 
            
85
estuarine processes of the northern Gulf of Mexico, field sites of our 
            
86
internationally-renowned faculty also include the Arctic, Mexico, 
            
87
Australia, and other countries.\r\n\r\nThe Dauphin Island Sea Lab also 
            
88
offers state and local government, industry, and agency 
            
89
decision-makers a range of coastal zone management services, including 
            
90
access to the nationally acclaimed data management center. Armed with 
            
91
data through the DISL data management center, entities can make 
            
92
well-informed decisions and sound policies while considering 
            
93
environmental impact. Another key contributor to successful coastal 
            
94
zone management is the Mobile Bay National Estuary Program, which 
            
95
falls within the services of DISL.\r\n\r\n",
            
60
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
96
    "id": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
n
61
    "image_url": "",
n
97
    "image_url": 
            
98
"2022-07-29-144848.512466DISL-centered-logo-w-Tag-CMYK.svg",
            
62
    "is_organization": true,
99
    "is_organization": true,
            
63
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
100
    "name": "dauphin-island-sea-lab",
            
64
    "state": "active",
101
    "state": "active",
            
65
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
102
    "title": "Dauphin Island Sea Lab",
            
66
    "type": "organization"
103
    "type": "organization"
            
67
  },
104
  },
            
68
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
105
  "owner_org": "cb136e67-d862-4b9e-af1c-e5c564cee512",
            
69
  "private": false,
106
  "private": false,
            
70
  "relationships_as_object": [],
107
  "relationships_as_object": [],
            
71
  "relationships_as_subject": [],
108
  "relationships_as_subject": [],
            
72
  "resources": [
109
  "resources": [
            
73
    {
110
    {
            
74
      "cache_last_updated": null,
111
      "cache_last_updated": null,
            
75
      "cache_url": null,
112
      "cache_url": null,
            
76
      "created": "2022-07-27T14:34:44.657629",
113
      "created": "2022-07-27T14:34:44.657629",
            
77
      "datastore_active": false,
114
      "datastore_active": false,
            
78
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
115
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": false,
            
79
      "description": null,
116
      "description": null,
            
80
      "format": "XML",
117
      "format": "XML",
            
81
      "hash": "",
118
      "hash": "",
            
82
      "id": "0460a2f2-e4db-4526-b3cf-9fa78d825764",
119
      "id": "0460a2f2-e4db-4526-b3cf-9fa78d825764",
            
83
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:44.611518",
120
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:44.611518",
            
84
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:45.065464",
121
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:34:45.065464",
            
85
      "mimetype": "application/xml",
122
      "mimetype": "application/xml",
            
86
      "mimetype_inner": null,
123
      "mimetype_inner": null,
            
87
      "name": "R4.x262.000-0059-metadata.xml",
124
      "name": "R4.x262.000-0059-metadata.xml",
            
88
      "package_id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
125
      "package_id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
            
89
      "position": 0,
126
      "position": 0,
            
90
      "resource_type": null,
127
      "resource_type": null,
            
91
      "size": 25215,
128
      "size": 25215,
            
92
      "state": "active",
129
      "state": "active",
            
93
      "url": 
130
      "url": 
            
94
2-e4db-4526-b3cf-9fa78d825764/download/r4.x262.000-0059-metadata.xml",
131
2-e4db-4526-b3cf-9fa78d825764/download/r4.x262.000-0059-metadata.xml",
            
95
      "url_type": "upload"
132
      "url_type": "upload"
            
96
    },
133
    },
            
97
    {
134
    {
            
98
      "cache_last_updated": null,
135
      "cache_last_updated": null,
            
99
      "cache_url": null,
136
      "cache_url": null,
            
100
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
137
      "ckan_url": "https://data.disl.edu",
            
101
      "created": "2022-07-27T14:34:45.090452",
138
      "created": "2022-07-27T14:34:45.090452",
            
102
      "datastore_active": true,
139
      "datastore_active": true,
            
103
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
140
      "datastore_contains_all_records_of_source_file": true,
            
104
      "description": null,
141
      "description": null,
            
105
      "format": "CSV",
142
      "format": "CSV",
            
106
      "hash": "277cc0be9338ad6ec212bcd129fca48b",
143
      "hash": "277cc0be9338ad6ec212bcd129fca48b",
            
107
      "id": "9d0bb894-0da4-45ea-adcd-cae707e6a138",
144
      "id": "9d0bb894-0da4-45ea-adcd-cae707e6a138",
            
n
108
      "ignore_hash": false,
n
145
      "ignore_hash": true,
            
109
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:45.049854",
146
      "last_modified": "2022-07-27T14:34:45.049854",
            
110
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:17.403263",
147
      "metadata_modified": "2022-07-27T14:38:17.403263",
            
111
      "mimetype": "text/csv",
148
      "mimetype": "text/csv",
            
112
      "mimetype_inner": null,
149
      "mimetype_inner": null,
            
113
      "name": "PRJNA631343 
150
      "name": "PRJNA631343 
            
114
Oiling_effects_on_Microphytobenthic_community.csv",
151
Oiling_effects_on_Microphytobenthic_community.csv",
            
115
      "original_url": 
152
      "original_url": 
            
116
wnload/prjna631343-oiling_effects_on_microphytobenthic_community.csv",
153
wnload/prjna631343-oiling_effects_on_microphytobenthic_community.csv",
            
117
      "package_id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
154
      "package_id": "5c4b921d-2ec9-4978-a15b-1ed431c6a9ca",
            
118
      "position": 1,
155
      "position": 1,
            
119
      "resource_id": "9d0bb894-0da4-45ea-adcd-cae707e6a138",
156
      "resource_id": "9d0bb894-0da4-45ea-adcd-cae707e6a138",
            
120
      "resource_type": null,
157
      "resource_type": null,
            
121
      "set_url_type": false,
158
      "set_url_type": false,
            
122
      "size": 8202,
159
      "size": 8202,
            
123
      "state": "active",
160
      "state": "active",
            
n
124
      "task_created": "2022-07-27 14:34:45.374316",
n
161
      "task_created": "2022-10-10 21:15:14.680266",
            
125
      "url": 
162
      "url": 
            
126
wnload/prjna631343-oiling_effects_on_microphytobenthic_community.csv",
163
wnload/prjna631343-oiling_effects_on_microphytobenthic_community.csv",
            
127
      "url_type": "upload"
164
      "url_type": "upload"
            
128
    }
165
    }
            
129
  ],
166
  ],
            
130
  "state": "active",
167
  "state": "active",
            
t
131
  "tags": [
t
168
  "tags": [],
            
132
    {

            
133
      "display_name": "Metagenomic",

            
134
      "id": "e78133f0-4cc7-44ef-8f8d-ee6a052a205b",

            
135
      "name": "Metagenomic",

            
136
      "state": "active",

            
137
      "vocabulary_id": null

            
138
    },

            
139
    {

            
140
      "display_name": "Microcosm",

            
141
      "id": "73b0cdbd-f69e-4078-81cd-bf885a7fad0d",

            
142
      "name": "Microcosm",

            
143
      "state": "active",

            
144
      "vocabulary_id": null

            
145
    },

            
146
    {

            
147
      "display_name": "Sediment metagenome",

            
148
      "id": "670fad8c-ca04-41cd-8378-55b7c6519b0b",

            
149
      "name": "Sediment metagenome",

            
150
      "state": "active",

            
151
      "vocabulary_id": null

            
152
    },

            
153
    {

            
154
      "display_name": "The Deepwater Horizon oil spill",

            
155
      "id": "0d74611e-2908-45e8-baab-2b35d2dd5a47",

            
156
      "name": "The Deepwater Horizon oil spill",

            
157
      "state": "active",

            
158
      "vocabulary_id": null

            
159
    },

            
160
    {

            
161
      "display_name": "benthic algae",

            
162
      "id": "39aa3a9a-231c-4d2f-ba76-2feb637bf2c8",

            
163
      "name": "benthic algae",

            
164
      "state": "active",

            
165
      "vocabulary_id": null

            
166
    },

            
167
    {

            
168
      "display_name": "diatoms",

            
169
      "id": "c0158589-0656-41f6-963b-c856b788d2d0",

            
170
      "name": "diatoms",

            
171
      "state": "active",

            
172
      "vocabulary_id": null

            
173
    },

            
174
    {

            
175
      "display_name": "tidal flat",

            
176
      "id": "e420d445-a514-475c-a1e9-69a28d375178",

            
177
      "name": "tidal flat",

            
178
      "state": "active",

            
179
      "vocabulary_id": null

            
180
    }

            
181
  ],

            
182
  "title": "Microphytobenthic community and microelectrode profile 
169
  "title": "Microphytobenthic community and microelectrode profile 
            
183
responses in oiled coastal marine sediment microcosms, based on 
170
responses in oiled coastal marine sediment microcosms, based on 
            
184
samples collected at Chandeleur Island, Louisiana and Estero Bay, 
171
samples collected at Chandeleur Island, Louisiana and Estero Bay, 
            
185
Florida in 2017",
172
Florida in 2017",
            
186
  "type": "dataset",
173
  "type": "dataset",
            
187
  "url": null,
174
  "url": null,
            
188
  "version": null
175
  "version": null
            
189
}
176
}